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PFGE概述



录入时间:2015-4-27 10:29:04 来源:青岛海博论坛论坛生物

PFGE的作用

聽PFGE是目前分子生物学技术在准确性,特异性,分辨率,重复性最好的方法之一。

聽染色体DNA经过特异性限制性内切酶的酶切作用,可以产生多条10-800kb的酶切片段,通过片断的多少和大小来比较细菌的同源性。

聽根据同源性来推断传染来源和途径;为更好的作好传染病的防治起到一定的作用。

PFGE方法步骤

一、胶块的制备

1、刮取适量新培养的细菌均匀浑浊于含有1ml细胞悬浊液的eppendorf中,调整OD值至4.0

2、取400聽μl聽CSBeppendorf管中置37度水浴中孵育5分钟。

3、在水浴管中加于20聽μl蛋白酶K20mg/ml)使其终浓度为0,5mg/ml

4、在eppendorf管中加入400聽μl1%Seakem聽Gold1%SDS),用枪头轻轻混匀。将混合物加入模具,避免产生气泡,室温下凝固10-15分钟。

二、细胞的裂解

1、每管中加入5ml蛋白酶K/CLB混合液。

2、将以制好的胶块加入管中,使其在液面下,将管子放在54 ℃水浴摇床中孵育2小时,转速约170/分钟。

三、洗胶块

1、从水浴摇床中取出管子,倒掉CLB,每管加入15ml预热的纯水,放回50聽℃水浴摇床中,摇15分钟。

2、倒掉水,用纯水再洗一次。

3、倒掉水,加入15ml预热的TE,放回50聽℃水浴摇床中,摇15分钟。

4、倒掉TE,用TE重复洗4次,每次15分钟。

5、倒掉TE聽,加入10mlTE,放在4聽℃冰箱保存备用。

四、酶切

1、小心取出TE中的胶块放干净的培养皿上。用刀片切2mm宽的胶块放入含200μl稀释液的eppendorf管中。放37聽℃水浴中孵育10-15分钟。

2、枪头吸出稀释液,避免损伤胶块。加入200μl酶切液,并确保胶块在液面下。放37聽℃水浴中孵育至少2小时。

五、加样

1、制胶。

2、聽从37聽℃水浴中取出管子,平衡到室温。吸出酶切液,加入200μl0.5聽鈽掽/span>TBE平衡。

3、用小铲将胶块加入加样孔中。并用溶化的胶封闭加样孔。

六、电泳

1、电泳槽中加入2.2L聽0.5聽鈽掽/span>TBE,盖好盖子。

2、打开主机和泵的开关。

3、打开冷凝机,确保温度在14℃。

4、把胶放入电泳槽,设置电泳参数。

5、关机。

七、分析结果

读胶,获取图像。

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